1、先天性畸形

2、分娩損傷

最為常見，約有85%-92%的直腸陰道瘺由分娩損傷引起。

3、手術(shù)損傷

任何破壞直腸陰道隔的手術(shù)均可能導致直腸陰道瘺，主要包括直腸手術(shù)和婦科手術(shù)。
4、炎癥性腸病

克羅恩病炎癥性病變可以貫穿腸管全層，繼而累及周圍組織和臟器，形成腸瘺。

5、放射性治療

盆腔的放射治療會增加胃腸損傷的發(fā)生率了。最常見于宮頸癌的放療，還可偶見于肛管、直腸、膀胱癌的放療。

6、感染

在陰道直腸間隙發(fā)生感染形成膿腫后，可壓迫并穿透陰道后壁。如直腸周圍膿腫、盆腔結(jié)核、血吸蟲病、前庭大腺囊腫等。

7、其他因素

如藥物腐蝕、異物損傷、暴力性行為、灌腸等。