N糖基化蛋白的相對(duì)分子質(zhì)量為原來(lái)蛋白質(zhì)的相對(duì)分子質(zhì)量加上其共價(jià)結(jié)合的N糖鏈的相對(duì)分子質(zhì)量。N糖基化蛋白的相對(duì)分子質(zhì)量在一定程度上可以作為糖鏈結(jié)構(gòu)鑒定的依據(jù)，用于判斷糖鏈的結(jié)構(gòu)正確與否。

N糖基化蛋白的相對(duì)分子質(zhì)量可以通過(guò)SDS-PAGE、HPLC以及質(zhì)譜法進(jìn)行測(cè)定。質(zhì)譜法具有檢測(cè)結(jié)果更加準(zhǔn)確、靈敏和直觀的優(yōu)點(diǎn)，已成為各類(lèi)化合物分子質(zhì)量分析的強(qiáng)有力工具。

基質(zhì)輔助激光解吸電離飛行質(zhì)譜（MALDI-TOF-MS）可直接測(cè)出相對(duì)分子質(zhì)量不太大、糖鏈結(jié)構(gòu)不十分復(fù)雜的糖蛋白，其檢測(cè)的大致流程與常規(guī)蛋白質(zhì)檢測(cè)一樣，需要先將糖蛋白水解為小分子肽段或糖肽，然后通過(guò)離子源電離為母離子進(jìn)行質(zhì)譜分析，根據(jù)質(zhì)譜數(shù)據(jù)計(jì)算肽段和糖肽的分子質(zhì)量，最后推算整個(gè)糖蛋白的相對(duì)分子質(zhì)量。

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