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代謝組與16S rDNA測(cè)序整合分析

2022-12-21 18:32 作者:百泰派克生物科技  | 我要投稿

代謝組學(xué)是對(duì)細(xì)胞、生物流體、組織或生物體內(nèi)的小分子(通常稱(chēng)為代謝物)的大規(guī)模研究。16S rDNA是編碼16S rRNA的基因,存在于所有細(xì)菌基因組。16S rDNA既能體現(xiàn)不同菌屬之間的差異,又能利用測(cè)序技術(shù)較容易地得到其序列,目前被廣泛用于病原菌的檢測(cè)和鑒定,以及不同微生物群落的屬或種系統(tǒng)進(jìn)化分類(lèi)。整合分析16S rDNA測(cè)序數(shù)據(jù)和代謝組學(xué)數(shù)據(jù),可揭示特定菌群與特定代謝物(群)之間的關(guān)聯(lián)性,篩選引起菌群代謝狀態(tài)或功能性代謝小分子變化的關(guān)鍵菌株。此外,通過(guò)代謝組學(xué)和16S rDNA測(cè)序整合分析的方法研究代謝物-微生物-疾病之間的關(guān)系,有助于發(fā)現(xiàn)疾病的生物標(biāo)志物以進(jìn)一步應(yīng)用于臨床輔助診斷等。如腸道微生物菌群與宿主代謝表型的關(guān)系以及微生物群落如何影響代謝功能的研究,就是代謝組學(xué)與16S rDNA測(cè)序記過(guò)整合分析的典型案例。


代謝組與16S rDNA測(cè)序整合分析流程

代謝組與16S rDNA測(cè)序整合分析流程



應(yīng)用領(lǐng)域

農(nóng)林領(lǐng)域:抗逆脅迫機(jī)制,物種保護(hù)研究等;
畜牧業(yè):致病機(jī)理研究,肉類(lèi)及乳制品品質(zhì)研究等;
海洋水產(chǎn):漁業(yè)環(huán)境與水產(chǎn)品安全等;
微生物:致病機(jī)理,耐藥機(jī)制,病原體-宿主相互作用研究等;
生物醫(yī)藥:生物標(biāo)志物,疾病機(jī)理機(jī)制,疾病分型,藥物開(kāi)發(fā),個(gè)性化治療等;
環(huán)境科學(xué):發(fā)酵過(guò)程優(yōu)化,生物燃料生產(chǎn),環(huán)境危害風(fēng)險(xiǎn)評(píng)估研究等;
食品科學(xué):食品儲(chǔ)藏及加工條件優(yōu)化,食品組分及品質(zhì)鑒定,食品安全監(jiān)檢測(cè)等。


代謝組與16S rDNA測(cè)序整合分析的評(píng)論 (共 條)

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