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每日科研進展 l 2022.07.02 l 雙鏈RNA的位置效應(yīng)影響科羅拉多馬鈴薯甲蟲的RNA干擾效率

2023-08-09 10:34 作者:RNA生物農(nóng)藥  | 我要投稿


靶向β-肌動蛋白基因的雙鏈RNA的位置效應(yīng)影響科羅拉多馬鈴薯甲蟲的RNA干擾效率

害蟲的抗藥性推動了基于?RNA?干擾?(RNAi)?的技術(shù)的發(fā)展,并將其作為一種新的害蟲防治方法。


圖1. 在ACT200s預(yù)測有效的siRNA

為了研究雙鏈?RNA (dsRNA)?位置依賴性的影響,研究人員設(shè)計了四種不同長度的?200 bp dsRNA,靶向科羅拉多馬鈴薯甲蟲?(CPB) β-肌動蛋白基因,稱為?dsACT200-1?到?dsACT200-4,以比較它們的對?CPB?幼蟲的殺蟲活性以及之前使用的?200 bp?和?700 bp的dsRNA(dsACT200?和?dsACT700)。每個?dsRNA?都含有不同數(shù)量的?siRNA,其中,dsACT200?和dsACT200-2?的?siRNA?數(shù)量比其他?200 bps dsRNA?的數(shù)量相對多(圖?1)。

圖2.飼喂不同長度dsRNA對CPB幼蟲的影響

使用體外合成的?dsRNA?染色馬鈴薯葉飼喂?CPB?幼蟲時,所有測試的?dsRNA?都顯示出對?CPB?幼蟲的顯著影響(圖?2)。


圖3. 預(yù)測的siRNA數(shù)量和靶序列上的分布都是設(shè)計有效 dsRNA 的重要因素

結(jié)合CPB幼蟲成活率、β-Actin基因表達水平和成活CPB幼蟲體重,同一等位基因的不同位置dsRNA對CPB幼蟲表現(xiàn)出不同的致死活性,并與預(yù)測的siRNA數(shù)量和靶標分布相關(guān)序列等研究結(jié)果,可以證實,合理設(shè)計?dsRNA?的特定等位基因位點觸發(fā)目標基因沉默的?RNAi?效率是增強殺蟲活性的重要因素(圖?3)。


原文鏈接:

https://doi.org/10.1016/j.pestbp.2022.105121


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