高新技術(shù)企業(yè)認定程序如下：
（1）自我評價。企業(yè)對照《高新技術(shù)企業(yè)認定管理辦法》和《高新技術(shù)企業(yè)認定管理工作指引》進行自我評價。
（2）注冊登記。企業(yè)登錄“高新技術(shù)企業(yè)認定管理工作網(wǎng)”（網(wǎng)址：www.innocom.gov.cn），按要求填寫《企業(yè)注冊登記表》，并通過網(wǎng)絡(luò)系統(tǒng)提交至山東省高新技術(shù)企業(yè)認定管理機構(gòu)（簡稱“認定機構(gòu)”，由山東省科技廳山東省財政廳山東省國稅局山東省地稅局組成）。認定機構(gòu)核對企業(yè)注冊信息，在網(wǎng)絡(luò)系統(tǒng)上確認激活后，企業(yè)可以開展后續(xù)申報工作。
（3）提交材料。企業(yè)登錄“高新技術(shù)企業(yè)認定管理工作網(wǎng)”，按要求填寫《高新技術(shù)企業(yè)認定申請書》，通過網(wǎng)絡(luò)系統(tǒng)提交至認定機構(gòu)，并向認定機構(gòu)提交書面材料。涉密企業(yè)須將申請認定高新技術(shù)企業(yè)的申報材料做脫密處理，確保涉密信息安全。
（4）專家評審。認定機構(gòu)收到企業(yè)申請材料后，按照《高新技術(shù)企業(yè)認定管理工作指引》 規(guī)定組織專家評審， 形成評審意見。
（5）認定報備。認定機構(gòu)結(jié)合專家組評審意見，對申請企業(yè)申報材料進行綜合審查（可視情況對部分企業(yè)進行實地核查），提出認定意見，確定認定高新技術(shù)企業(yè)名單，報全國高新技術(shù)企業(yè)認定管理工作領(lǐng)導小組辦公室備案。
（6） 公示公告。經(jīng)認定報備的企業(yè)名單，由全國高新技術(shù)企業(yè)認定管理工作領(lǐng)導小組辦公室在“高新技術(shù)企業(yè)認定管理工作網(wǎng)”公示 10 個工作日。無異議的，予以備案，核發(fā)證書編號，并在“高新技術(shù)企業(yè)認定管理工作網(wǎng)”上公告企業(yè)名單，由認定機構(gòu)向企業(yè)頒發(fā)統(tǒng)印制的“高新技術(shù)企業(yè)證書”。