結構活性關系SAR技術在處理大型和不斷擴展的數(shù)據(jù)源方面發(fā)揮著越來越大的作用。結構活性關系技術被廣泛應用，包括：虛擬化學文庫的計算機模擬設計，以探索分子多樣性進行后續(xù)合成和篩選；篩選專有的、商業(yè)化的和公共的數(shù)據(jù)庫以發(fā)現(xiàn)先導化合物；以及，從微陣列實驗中挖掘基因表達數(shù)據(jù)用于目標識別。SAR分析可以檢測對生物體具有生物學作用的官能團，官能團通過改變其化學結構來促進生物活性化合物的修飾?；瘜W家使用先進的化學合成技術將新的化學基團引入生物醫(yī)學化合物中，并測試修飾對化合物生物學功能的影響，也可被改進用來建立化學結構與生物活性之間的數(shù)學關系，稱為定量結構活性關系（QSAR）。SAR分析的基本假設是相似的分子具有相同的功能。因此，潛在的問題是如何在分子水平上定義小差異，因為每種活性（如反應能力、溶解度、目標活性）還可能與另一種差異有關。