蛋白質(zhì)組學(xué)（英語：proteomics，又譯作蛋白質(zhì)體學(xué)），是以蛋白質(zhì)組為研究對象，研究細胞、組織或生物體蛋白質(zhì)組成及其變化規(guī)律的科學(xué)。這個概念最早是在1994年，由Marc Wikins首先提出的新名詞。

上周二分享了蛋白產(chǎn)品相關(guān)問題（一），本周二將分享蛋白產(chǎn)品相關(guān)問題（二）~

現(xiàn)在小編將帶您進入今日主題

6.?iTRAQ/TMT蛋白組學(xué)分析的優(yōu)點是什么？

答案：通過不同分子量的實際對不同來源樣品進行標記的方式，實現(xiàn)不同樣品間蛋白質(zhì)組比較的目標，兩種方法都一次性完成（iTRAQ 8個/TMT 16個）全部樣品的定性定量分析，降低了實驗誤差，排除儀器造成的樣本間差異，穩(wěn)定性更高，操作簡單，數(shù)據(jù)分析流程簡單，適用于所有物種蛋白的定量分析。

7.?TMT?對儀器有哪些要求，目前有哪些儀器可以做該實驗？

答案：TMT試劑標簽之間的質(zhì)量差額在0.006Da左右，需要質(zhì)譜二級分辨率在50K以上才能準確分辨出不同的報告離子，因此只有在高分辨質(zhì)譜儀上才能完成標記定量實驗。主流儀器有Thermo fisher QE系列質(zhì)譜儀、fusion系列質(zhì)譜儀、AB sciex QTOF系列質(zhì)譜儀。

8.?我們公司的標記實驗流程？

答案：蛋白質(zhì)提取，出具蛋白質(zhì)控報告，反饋客戶，肽段酶解，多肽標記，HPLC分餾分，質(zhì)譜數(shù)據(jù)采集，數(shù)據(jù)分析出具結(jié)題報告。

9.?iTRAQ&TMT?標記實驗時需注意哪些問題，對樣品有什么要求

答案：iTRAQ&TMT適用于相同組織的相對定量分析，不能進行有或無的鑒定，不能將不同的組織部位一起標記上機，更不能將不用物種的樣本一起上機；對蛋白總量需求較LFQ要高，100ug以上。

10.?不同組織類型的樣本做?iTRAQ /TMT能否同組上機？

答案：同一批上機的樣本必須是相同物種、相同組織類型才能一批上機和一起分析。搜庫時是鑒定其共有蛋白，差異分析也是共有蛋白在定量值上的差異倍數(shù)FC。如果選擇不同樣本類型的樣本，他們的特異性蛋白就會被過濾掉。

本周的FAQ就到此結(jié)束啦~

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