鳥槍法蛋白組學(xué)
鳥槍法蛋白質(zhì)組學(xué)是基于液相色譜和質(zhì)譜技術(shù)的一種分析蛋白質(zhì)組的方法，擺脫了傳統(tǒng)凝膠分離技術(shù)的局限和不足。百泰派克生物科技提供鳥槍法分析蛋白質(zhì)組的服務(wù)。
鳥槍法蛋白組學(xué)
鳥槍法（shotgun）蛋白質(zhì)組學(xué)是指將自下而上（bottom-up）的蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)結(jié)合使用高效液相色譜與質(zhì)譜聯(lián)用來鑒定復(fù)雜混合物中的蛋白質(zhì)。該名稱源于DNA的鳥槍法（shotgun）測序。鳥槍法蛋白質(zhì)組學(xué)最常用的方法是從消化混合物中的蛋白質(zhì)開始，然后通過液相色譜法分離得到的肽段，接著使用串聯(lián)質(zhì)譜法鑒定肽段。鳥槍法蛋白質(zhì)組學(xué)允許鑒定樣品全部蛋白質(zhì)，并具有系統(tǒng)分析動態(tài)蛋白質(zhì)組的能力。它還避免了與完整蛋白質(zhì)分析相關(guān)的中等分離效率和較差的質(zhì)譜靈敏度。常見的label free、SILAC和iTRAQ定量蛋白質(zhì)組學(xué)分析都是基于鳥槍法進(jìn)行的。
鳥槍法蛋白組學(xué)流程
鳥槍法蛋白組學(xué)實(shí)驗(yàn)中，首先是從樣品中提取蛋白質(zhì)，并用蛋白酶消化以產(chǎn)生肽段混合物。然后將肽混合物直接上樣到液相色譜柱上進(jìn)行分離，分離后的肽段經(jīng)電離成為離子，最后進(jìn)入串聯(lián)質(zhì)譜（MS/MS）進(jìn)行解析。利用計(jì)算機(jī)根據(jù)設(shè)定好的運(yùn)算法則分析所得數(shù)據(jù)，可以從理論蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫中檢索出測得的肽段對應(yīng)的蛋白質(zhì)，從而確定樣品中的蛋白質(zhì)成分。
相關(guān)服務(wù)：
定量蛋白組分析
基于Label Free的定量蛋白組分析
基于SILAC/Dimethyl標(biāo)記的定量蛋白組分析
TMT/iTRAQ/MultiNotch定量蛋白組學(xué)分析
