生物信息學(xué)一非生信人如何看懂生信圖合集1（1一16）
> 火山圖
- 常和熱圖一起出現(xiàn)，展示差異表達(dá)的基因
- 芯片、測序等組學(xué)檢測技術(shù)結(jié)果
- 上調(diào)或下調(diào)，橫坐標(biāo)用倍數(shù)（以2為底的對數(shù)）表示，縱坐標(biāo)為p值的負(fù)對數(shù)
> 熱圖
- 用于展示各種基因或RNA在不同樣本中的表達(dá)
- 給每一個數(shù)值分配顏色
- 可獲得兩組中多個樣本多個基因的全局直觀變化
- 聚類，樣本和樣本之間，表達(dá)模式相似（比喻：目錄）
- 整體表達(dá)模式，不能看到單個基因的表達(dá)
- 延伸用法：藥物處理樣本的結(jié)果
- 和火山圖一起展示差異性基因表達(dá)結(jié)果
> 基因集 富集分析 GSEA
- 以上兩種，基于篩選的差異基因，富集分析是不篩選的差異基因
- 例：某通路中所有的基因
標(biāo)簽：
