肛門直腸疼痛的原因有多種。由于個體的差異、病種的不同、發(fā)病部位不一，對疼痛的敏感程度也不盡相同。

（1）手術(shù)后疼痛：肛門直腸手術(shù)往往刺激、損傷齒線以下的肛管組織，創(chuàng)面神經(jīng)末梢暴露，受到如糞便、分泌物、藥物等外界刺激，引起劇烈疼痛。手術(shù)后肛門水腫、血栓形成，或受創(chuàng)口內(nèi)異物刺激、便秘、糞便嵌頓等均可引起疼痛。

（2）炎癥性疼痛：由于局部感染導致發(fā)炎、潰爛、腫脹、化膿引起的疼痛。

（3）排便疼痛：不健康的排便習慣，或者有肛周原發(fā)疾病如肛裂的存在，使排便時糞便沖擊造成疼痛。

（4）瘢痕性疼痛：各種原因?qū)е赂刂荞：坌纬?，瘢痕壓迫神?jīng)導致陣發(fā)性疼痛。

（5）血栓性疼痛：血栓性外痔、內(nèi)痔血栓形成，均會導致肛周疼痛。

（6）神經(jīng)精神因素：自主神經(jīng)紊亂、陰部神經(jīng)綜合征等都會導致疼痛。