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基于R語(yǔ)言的微生物群落組成分析—α多樣性指數(shù)的正態(tài)分布檢驗(yàn)及差異性標(biāo)注

2022-10-17 10:38 作者:科研那點(diǎn)事兒  | 我要投稿

? ? ? ?此前,小編已經(jīng)給大家展示過(guò)如何使用R語(yǔ)言進(jìn)行微生物群落的Alpha-多樣性指數(shù)計(jì)算及簡(jiǎn)單的顯著性標(biāo)記,也給大家展示了如何使用字母標(biāo)記法給數(shù)據(jù)進(jìn)行差異性標(biāo)注,感興趣的小伙伴可以翻翻此前推文進(jìn)行查看。今天,小編給大家展示的內(nèi)容就是基于此前內(nèi)容進(jìn)行結(jié)合分析,為大家展示如何為Alpha-多樣性指數(shù)進(jìn)行正態(tài)分布檢驗(yàn)及字母標(biāo)記以顯示其數(shù)據(jù)間的差異性。

工作目錄設(shè)置及R包加載

數(shù)據(jù)加載

這里我們使用的數(shù)據(jù)是基于此前推文相同代碼計(jì)算的Alpha-多樣性指數(shù),具體計(jì)算方法這里不做闡述:

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ACE指數(shù)的正態(tài)分布檢驗(yàn)及差異性標(biāo)注

1、檢驗(yàn)數(shù)據(jù)是否符合正態(tài)分布

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#無(wú)論Bartlett檢驗(yàn)還是Levene檢驗(yàn),兩者的P值都大于0.05,,所以接受原假設(shè):樣本之間的方差是相同的,繼續(xù)做方差分析

2、方差檢驗(yàn)

3、多重比較

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4、可視化

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Chao指數(shù)的正態(tài)分布檢驗(yàn)及差異性標(biāo)注

與ACE指數(shù)分析類(lèi)似:

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Shannon指數(shù)的正態(tài)分布檢驗(yàn)及差異性標(biāo)注

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Simpson指數(shù)的正態(tài)分布檢驗(yàn)及差異性標(biāo)注

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拼圖并進(jìn)行圖片美化

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AI調(diào)整后:

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數(shù)據(jù)及源碼獲?。汗娞?hào)【科研后花園】后臺(tái)回復(fù)關(guān)鍵詞“2022-10-17”獲取下載鏈接!




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