一、DNA帶缺失

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原因：①小DNA帶走出凝膠

解決方式：縮短電泳時(shí)間，降低電壓，增強(qiáng)凝膠濃度

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原因：②分子大小相近的DNA帶不易分辨

解決方式：增加電泳時(shí)間，核準(zhǔn)正確的凝膠濃度

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原因：③DNA變性

解決方式：電泳前請(qǐng)勿高溫加熱DNA鏈，以20mMNacl Buffer稀釋DNA

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原因：④DNA鏈巨大，常規(guī)凝膠電泳不合適

解決辦法：在脈沖凝膠電泳上分析

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二、DNA帶模糊

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原因：①DNA降解

解決辦法：避免核酸酶污染

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原因：②電泳緩沖液陳舊

解決辦法：電泳緩沖液多次使用后，離子強(qiáng)度降低。pH值上升，緩沖能力減弱，從而影響電泳效果。建議經(jīng)常更換電泳緩沖液

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原因：③所用電泳條件不合適

解決辦法：電泳時(shí)電壓不應(yīng)超過(guò)20V/cm，溫度＜30℃；巨大DNA鏈電泳，溫度應(yīng)＜15攝氏度；核查所用電泳緩沖液是否有足夠的緩沖能力

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原因：④DNA上樣量過(guò)多

解決辦法：減少凝膠中DNA上樣量

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原因：⑤DNA樣含鹽過(guò)高

解決辦法：電泳前通過(guò)乙醇沉淀去除過(guò)多的鹽

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原因：⑥有蛋白污染

解決辦法：電泳前酚抽提去除蛋白

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原因：⑦DNA變性

解決辦法：電泳前勿加熱，用20mM NacI緩沖液稀釋DNA

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三、不規(guī)則DNA帶遷移

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原因：①對(duì)λ/Hird 11I片段cos位點(diǎn)復(fù)性

解決辦法：電泳前于65℃加熱DNA 5分鐘，然后在冰上冷卻5分鐘

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原因：②電泳條件不合適

解決辦法電泳電壓不超過(guò)20V/cm；溫度＜30℃；經(jīng)常更換電泳緩沖液

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原因：③DNA變性

解決辦法：以20mM Nacl Buffer稀釋DNA，電泳前勿加熱

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四、帶弱或無(wú)DNA帶

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原因：①DNA的上樣量不夠

解決辦法：增加DNA的上樣量；聚丙烯酰胺凝膠電泳比瓊脂電泳靈敏度稍高，上樣量可適當(dāng)降低

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原因：②DNA降解

解決辦法:避免DNA的核酸酶污染

原因：③DNA走出凝膠

解決辦法：縮短電泳時(shí)間，降低電壓，增強(qiáng)凝膠濃度

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原因：④對(duì)于EB染色的DNA，所用光源不合適

解決辦法：應(yīng)用短波長(zhǎng)（254nm）的紫外光源