「青蓮聚焦」一文告訴你蛋白組學(xué)與疾病分型和標(biāo)志物研究

多形膠質(zhì)母細(xì)胞瘤(GBM)是一種致命的成人腦癌,生存周期為12-15個月。目前可用的治療方法為全切除、放療和化療或結(jié)合DNA烷基化替莫唑胺,90%存在復(fù)發(fā)。絕大多數(shù)研究是利用基因組、轉(zhuǎn)錄組和表觀遺傳學(xué)等試圖確定主要致癌事件和治療干預(yù)可操作點,但這些基于突變和基于轉(zhuǎn)錄組的方法在臨床上的應(yīng)用仍然有限,只有少數(shù)生物標(biāo)志物,在膠質(zhì)母細(xì)胞瘤背景下的大規(guī)模蛋白質(zhì)組學(xué)特征尚未報道,因此利用蛋白組學(xué)建立預(yù)測性生物標(biāo)志物或患者分型策略以用于開發(fā)靶向療法仍是挑戰(zhàn)。
2020年7月來自韓國的Hyun Seok Kim團(tuán)隊在《Nature Communications》發(fā)表了題為“Integrated pharmaco-proteogenomics defines two subgroups in isocitrate dehydrogenase wild-type glioblastoma with prognostic and therapeutic opportunities”的文章。該研究對50例整合了基因組、轉(zhuǎn)錄組學(xué)和臨床信息并進(jìn)行了神經(jīng)膠質(zhì)瘤組織進(jìn)行了蛋白質(zhì)組學(xué)和磷酸化蛋白質(zhì)組學(xué)檢測,深入了解了GBM起源細(xì)胞中的腫瘤間和腫瘤內(nèi)異質(zhì)性、致癌信號傳導(dǎo)和代謝途徑,突出了IDH野生型GBM患者的潛在有效預(yù)后和治療策略。





