蛋白質(zhì)是由氨基酸脫水縮合形成的生物大分子，氨基酸的排列順序以及種類在很大程度上決定了蛋白的空間結(jié)構(gòu)和生物學(xué)功能。因此，氨基酸序列分析在揭示蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)和功能方面發(fā)揮著重要的作用，也為人工合成活性多肽提供了依據(jù)。?

氨基酸序列測定方法主要包括非質(zhì)譜法和質(zhì)譜法。非質(zhì)譜法中最出名也最常用的就是傳統(tǒng)的Edman降解法，主要用于蛋白質(zhì)的N末端測序，但它不能對N末端封閉或修飾的序列進行測定。基于質(zhì)譜的測序方法可以用于蛋白質(zhì)的末端（N/C端）測序、蛋白全序列測定、從頭測序和突變分析。質(zhì)譜測序法通過分析測量離子的質(zhì)荷比質(zhì)譜圖來確定氨基酸的分子質(zhì)量，再結(jié)合相應(yīng)的數(shù)據(jù)庫推斷氨基酸的種類。質(zhì)譜法簡便快速、靈敏性高，也可以對N末端封閉或修飾的序列進行分析，在一定程度上克服了Edman測序法的缺點。?

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