代謝組學(xué)主要是通過(guò)對(duì)生物體的內(nèi)源性小分子代謝物進(jìn)行定性和定量分析來(lái)闡明機(jī)體在不同生長(zhǎng)時(shí)期或受其他刺激時(shí)的分子機(jī)制，揭示生命活動(dòng)的本質(zhì)規(guī)律。質(zhì)譜技術(shù)可以對(duì)化合物進(jìn)行快速高效的定性分析和準(zhǔn)確的定量，是代謝組學(xué)分析的強(qiáng)有力工具。

代謝組學(xué)質(zhì)譜就是利用質(zhì)譜技術(shù)進(jìn)行代謝組學(xué)分析，通常聯(lián)合質(zhì)譜技術(shù)與色譜技術(shù)分析復(fù)雜混合代謝物樣本，色譜技術(shù)主要用于實(shí)現(xiàn)各代謝物的分離。色譜-質(zhì)譜聯(lián)用技術(shù)包括液相色譜-質(zhì)譜聯(lián)用（LC-MS）和氣相色譜-質(zhì)譜聯(lián)用（GC-MS）。LC-MS以液體作為流動(dòng)相，不需要對(duì)樣本進(jìn)行衍生化，適于分析一些熱不穩(wěn)定、不易揮發(fā)的分子量在1000Da以內(nèi)的大分子極性代謝物，如有機(jī)酸、核苷、核苷酸和多胺等。GC-MS以氣體作為流動(dòng)相，因此需要將代謝物樣本通過(guò)復(fù)雜的化學(xué)衍生化處理轉(zhuǎn)化為氣態(tài)，GC/MS所檢測(cè)的代謝物類(lèi)型與LC-MS互補(bǔ)，主要擅長(zhǎng)對(duì)熱穩(wěn)定的、易揮發(fā)的分子質(zhì)量在300Da以內(nèi)的非極性小分子代謝物進(jìn)行分析鑒定，而對(duì)不揮發(fā)的代謝物無(wú)能為力。